2022年8月に最終回を迎えた特撮テレビドラマ「仮面ライダーリバイス」と同年12月公開の映画「仮面ライダーギーツ×リバイス MOVIE バトルロワイヤル」の続編となるVシネマ作品。 五十嵐大二はフェニックスの後継組織「ブルーバード」で平和維持活動に奔走する日々を送っていた。一方、遺伝子工学の権威・市村博士の研究の成果により、同組織の隊長・門田ヒロミの肉体に回復の兆しが見え始める。そんな中、“ギフ亡き新時代のガーディアン”を名乗る組織「アリコーン」が現れ、ある目的のために少年少女たちを誘拐・監禁する。ブルーバードは救出作戦に乗り出すが、ヒロミが被害者の少女・留美を連れ去った疑いで指名手配される事態に。さらに大二たちの前に、ヒロミと同じ顔の人物・ムラマサが姿を現す。